水木清华校友种子基金成立于2014年10月，基金的创始合伙人包括李竹（1984计算机）、杜艳（1981环境）、余龙文（1984材料）等，是国内第一支高校校友基金，致力于成为“清华校友创业第一站”，为校友创业开出第一张支票，基金的GP全是清华校友，也只投清华校友的项目。
水木清华校友种子基金深度挖掘种子期或天使期的清华校友创业项目，重点投资新能源、新一代信息技术、新材料、半导体、生命科学领域，再利用清华校友网络进行深度赋能，在融资、销售、团队、认知等领域全方位帮助校友创业者。
水木清华校友种子基金与英诺天使基金、启迪之星创投、泰有基金共4家基金，组成清华系早期投资F4，在投前投后紧密合作，并与其他投资机构建立广泛链接，共同助力清华校友硬科技创业。